辞职员工可凭调休单要求支付加班工资，但需与公司协商一致。如协商不一致，休息日加班可优先安排员工休，否则需支付加班费。如公司不遵守规定，员工可申请劳动仲裁并提供相关材料。
法律分析
辞职员工是否可以凭调休单要求支付加班工资
可以。
首先，公司安排加班时，按规定要与员工协商，如果双方对加班调休与加班费协商一致，那么员工加班后即可以自主选择加班补偿。
因为约定劳动合同时，按照双方意思自治原则，所以只要双方对约定达成一致，那么便可以按该约定进行。
其次，双方协商不一致的，原则上，在休息日安排加班的，可以优先安排员工休，如果实在不能安排调休，就要支付加班费。
因此，一般情况下，未能协商给予员工自主权的，就要按照这个方法选择调休还是支付加班费。
最后，公司安排员工加班后，又不肯按规定进行调休或支付加班费的，必要时可以按照以下步骤申请劳动仲裁：
1、先要准备好如下材料：
(1)劳动争议申诉书一式三份；
(2)到工商局查询公司的工商登记资料一份；
(3)本人的身份证复印件一份；
(4)复印证据资料一式三份，如劳动合同或协议、工资单、工牌、上班打卡记录、同事的证人证言等。
2、向有管辖权的劳动仲裁委员会申请仲裁，一般都是向所在区、县的劳动仲裁委员会申请仲裁。
另外，员工加班后一般是根据公司的安排确定调休还是支付加班费，如果未按规定进行加班补偿的，就要根据以上规定申请劳动仲裁，或是劳动仲裁处理不下的，还可以接着去法院起诉。
结语
员工在辞职后是否可以凭调休单要求支付加班工资？答案是肯定的。根据劳动法规定，公司与员工在加班安排上应进行协商，如果双方一致同意将加班补偿以调休形式进行，员工可以自主选择。根据双方意思自治原则，只要达成一致约定，就可以按照约定执行。如果双方无法达成一致，且在休息日进行加班，公司应优先安排员工休假，无法安排调休的情况下，应支付加班费。如果公司不按规定进行调休或支付加班费，员工可以申请劳动仲裁或起诉法院解决。
法律依据
中华人民共和国劳动合同法（2012修正）：第四章 劳动合同的解除和终止 第四十条 【无过失性辞退】有下列情形之一的，用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，可以解除劳动合同：
（一）劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的；
（二）劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的；
（三）劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行，经用人单位与劳动者协商，未能就变更劳动合同内容达成协议的。
中华人民共和国劳动合同法（2012修正）：第四章 劳动合同的解除和终止 第三十九条 【用人单位单方解除劳动合同（过失性辞退）】劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：
（一）在试用期间被证明不符合录用条件的；
（二）严重违反用人单位的规章制度的；
（三）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；
（四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；
（五）因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；
（六）被依法追究刑事责任的。
中华人民共和国劳动合同法（2012修正）：第四章 劳动合同的解除和终止 第四十一条 【经济性裁员】有下列情形之一，需要裁减人员二十人以上或者裁减不足二十人但占企业职工总数百分之十以上的，用人单位提前三十日向工会或者全体职工说明情况，听取工会或者职工的意见后，裁减人员方案经向劳动行政部门报告，可以裁减人员：
（一）依照企业破产法规定进行重整的；
（二）生产经营发生严重困难的；
（三）企业转产、重大技术革新或者经营方式调整，经变更劳动合同后，仍需裁减人员的；
（四）其他因劳动合同订立时所依据的客观经济情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行的。
裁减人员时，应当优先留用下列人员：
（一）与本单位订立较长期限的固定期限劳动合同的；
（二）与本单位订立无固定期限劳动合同的；
（三）家庭无其他就业人员，有需要扶养的老人或者未成年人的。
用人单位依照本条第一款规定裁减人员，在六个月内重新招用人员的，应当通知被裁减的人员，并在同等条件下优先招用被裁减的人员。
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