房产证没过户但有协议有效。房产证没过户导致房屋存在产权登记的障碍属于物权变动问题，不影响协议效力。房屋依法发生债权的效力，不发生物权变动的效力。
《民法典》第二百零九条 不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。 第二百一十五条 当事人之间订立有关设立、变更、转让和消灭不动产物权的合同，除法律另有规定或者当事人另有约定外，自合同成立时生效；未办理物权登记的，不影响合同效力。
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