法律分析：因为深圳与东莞的社保缴费基数不同，也就是说缴费的多少不同，当然会影响你以后的养老金领取的多少。你离开深圳后，公司就会给你办理停保手续，办好后，你在公司所在地的社保局经办机构给你打印社保缴费凭证，然后你去到工作地，你可以在当地参保，为了医保的连接性，最好是一停保后马上续保。以后你可以将社保迁移到一个地方计算累计缴费年限。
法律依据：根据《社会保险法》第三十二条规定：个人跨统筹地区就业的，其基本医疗保险关系随本人转移，缴费年限累计计算。根据《社会保险法》第五十二条规定：职工跨统筹地区就业的，其失业保险关系随本人转移，缴费年限累计计算。