法律分析：员工获得的经济补偿金要扣个税。
个人因与用人单位解除劳动关系，而取得的一次性补偿收入，其收入在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，免征个人所得税。超过的部分按照的有关规定，计算征收个人所得税。
应纳税所得额的计算方法如下：
1、居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额，减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额；
2、非居民个人的工资、薪金所得，以每月收入额，减除费用五千元后的余额为应纳税所得额。劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得，以每次收入额为应纳税所得额；
3、经营所得，以每一纳税年度的收入总额减除成本、费用以及损失后的余额，为应纳税所得额。
4、财产租赁所得，每次收入不超过四千元的，减除费用八百元。四千元以上的，减除百分之二十的费用，其余额为应纳税所得额。
法律依据：《中华人民共和国个人所得税法》
第二条 下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：
（一）工资、薪金所得；
（二）劳务报酬所得；
（三）稿酬所得；
（四）特许权使用费所得；
（五）经营所得；
（六）利息、股息、红利所得；
（七）财产租赁所得；
（八）财产转让所得；
（九）偶然所得。
居民个人取得前款第一项至第四项所得（以下称综合所得），按纳税年度合并计算个人所得税；非居民个人取得前款第一项至第四项所得，按月或者按次分项计算个人所得税。纳税人取得前款第五项至第九项所得，依照本法规定分别计算个人所得税。