法律分析：对公司内部犯罪行为进行调查是公司职责之一，但应遵循法律程序。公司应制定合理的内部调查程序，保护员工权利、确保证据收集的合法性并避免干扰任何潜在的刑事调查。
法律依据：
1.《劳动法》第三十六条：用人单位应当制定和公布与劳动者权益相关的规章制度，并保证其严格执行。
2. 《刑事诉讼法》第九十二条：被害人、民事诉讼代理人或者其他人员，有权在刑事诉讼中提供证据、出庭作证或者陈述意见。
3. 《公司法》第七十三条：公司应当建立有效的内部监督机制，防范和遏制内部犯罪行为。
4. 《中华人民共和国刑法》第二十六条：单位犯罪，由单位承担刑事责任。
以上是关于如何进行公司内部调查以防止公司犯罪的法律分析和法律依据。公司应当建立合理的内部调查程序，并遵循法律程序进行调查，以保护员工权益和维护公司利益。同时，公司还应注意避免干扰任何潜在的刑事调查。