逾期支付购房款的违约金的计算方式如下：
1、买卖双方在购房合同中约定逾期支付购房款违约责任的，按约定计算。但是，如果约定的违约金高于或低于实际损失，则可以要求减少或增加违约金；
2、合同未约定违约金金额或者损失赔偿金额的计算方法的，可以根据房屋延期交付使用期间有关主管部门公布或者有资质的房地产评估机构评估的同一地段同类房屋租金标准确定。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民法典》
第五百八十五条 当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。