土地管理部门。村民在自己的宅基地上改建房屋，首先必须具有《集体建设用地使用证》。如果该宅基地属于城镇规划范围内，则需要规划部门出具改建房屋选址意见和《规划许可证》；如果属于城镇规划范围之外，则需要经过土地管理部门对改建房屋的面积变动进行审批，然后方可改建。批准后再到规划部门办理建筑许可证，等房屋建成完工了，再带着这些手续去当地房管所办理房屋所有权证就可以了。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国土地管理法》第七十八条农村村民未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地建住宅的，由县级以上人民政府农业农村主管部门责令退还非法占用的土地，限期拆除在非法占用的土地上新建的房屋。超过省、自治区、直辖市规定的标准，多占的土地以非法占用土地论处。