在存货质押监管中，确定质权人的权益是非常重要的，可以通过以下几种方式来确保质权人的权益：
协议约定：在存货质押协议中，明确约定质权人的权益，包括质押物的种类、数量、价值、质权人的优先权等内容。确保协议中的条款能够保障质权人的权益。
质押物评估：在质押物评估过程中，由第三方专业评估机构对质押物进行评估，确保质押物价值的准确性。评估结果将直接影响质权人的权益，因此评估过程应当严格、客观、公正。
监管机构监督：可以由监管机构对存货质押交易进行监管，确保质权人的权益得到保障。监管机构可以对存货质押交易的合规性、透明度进行监督，及时发现并解决问题。
风险控制措施：质权人可以要求质押人提供担保措施，如保证金、风险准备金等，以应对可能出现的风险情况，保护自身权益。
法律保护：在存货质押交易中，质权人的权益受到法律保护，可以依法主张权利，维护自身合法权益。在签订存货质押协议时，应当遵循相关法律法规，确保合同的合法性和有效性。
综上所述，确定质权人的权益需要通过协议约定、质押物评估、监管机构监督、风险控制措施和法律保护等方式来确保，从而保障质权人的权益不受损害。