1、中医认为，荠菜性味甘、凉，入肝、脾、肺经，有清热止血、清肝明目、利尿消肿之功效。《名医别录》言其“主利肝气，和中”。《千金·食治》言其“杀诸毒，根，主治目涩痛”。《食经》言其“补心脾”。《陆川本草》言其“消肿解毒，治疮疖，赤眼”。
2、药理研究表明，荠菜含有类似麦角样成分，有催产素样作用，其浸膏对动物离体子宫和肠管均有明显收缩功能。
3、荠菜提取物用于高血压的治疗，其疗效优于芦丁，而且无毒性。荠菜还含有荠菜酸，能缩短凝血时间，故又被广泛用于内伤出血、咯血、产后子宫出血、月经过多、便血、尿血、消化道溃疡出血、视网膜出血、牙龈出血等。
4、近年来，荠菜入药，用来治疗胆石症、尿石症、乳糜尿、胃溃疡、痢疾、肠炎、腹泻、呕吐、目赤肿痛、结膜炎、夜盲症、青光眼等，均收到了较好疗效。