小规模纳税人季度申报流程如下：1、小规模纳税人申报时必须先抄报税后，方可正常申报，未进行税控设备抄报税的纳税人无法网上申报。2、小规模纳税人申报时，应准确填写申报，符合系统比对规则后方可正常申报。对申报比对不通过的，网报系统会提示纳税人比对不符原因，并引导纳税人修改申报数据。纳税人须要按系统提示准确修改申报数据，符合系统比对后方可正常上传申报数据。3、纳税人正常比对通过后，可正常清卡解锁。若纳税人申报时经反复核对仍无法正常申报，则可按照系统提示正常上报但暂不扣缴税款，携一证通、税控设备、增值税申报表、营业执照、经办人身份证到办税服务厅办理相关申报事宜。